Егор Алексеевич Ткаченко родился 15 апреля 2003 года в городе Алматы.

Ткаченко начал заниматься футболом в семилетнем возрасте в алматинской «Цесне».

В 2012 году Егор попал в Академию ФК «Кайрат». Он прошёл все возрастные этапы академии.

В составе юношеской сборной Казахстана выступал в Кубке Развития УЕФА, дважды участвовал в Кубке Президента Казахстана, а также в квалификации Чемпионата Европы 2019/20.

Первую половину сезона 2021 года защитник начинал в «Кайрат-Жастар» в Первой лиге Казахстана, а осенью того же года Ткаченко пополнил ФК «Кайрат-Москва».

В феврале 2022 года Егор подписал контракт с основной командой ФК «Кайрат», а в апреле дебютировал в матче 7-го тура Чемпионата Казахстана против «Турана» (0:1).